记者了解到，目前在泛珠三角、环渤海地区都有一套正式的政府间协调机制。在泛珠三角，这套机制是由四个层次的制度组成，环渤海地区则是三个层次。而在长三角，例行的协调机构是长三角城市经济协调会，但不少业内专家都认为这样的制度还是“偏软”，协调机构如何维持公信力是一个难题。

　　记者了解到，长三角两省一市各有其自身特色：浙江经济体以民营中小企业为主，上海经济体以外资与大型国企为主，江苏经济体则以国有控股为主。此次区域经济规划的重点就在于统筹政策与制定一体化的目标。“这次规划将原本在三种模式上起跑的三个地域，统一到长三角范畴内。 ”浙江大学国际经济研究所所长赵伟认为，在大长三角范畴里制定经济政策、规划交通，给予银行贷款，可以实现整个长三角地域的产业升级，但毕竟两省一市有各自的行政体制，长三角一体化在实际操作中面临的困难也不小。 ”

　　政协全国委员会副主席厉无畏曾建议直接建立类似 “长三角合作与发展委员会”的独立机构。中国生产力学会会长王茂林则为这个设想的机构定下了发展基调，认为这个机构应该编制一个到2020年的规划，用以指导长三角发展。另据专家介绍，利益协调还可以包括“利益分享”和“利益补偿”两个方面。